تحقیقات تازه در باب ساختار ژنوم لاک‌پشت‌های نهان‌گردن

دانشمندان دو دانشگاه آ یو اِی بی و آیووا استیت موفق شدن ژنوم دو گونه از لاک‌پشت‌های نهان‌گردن رو که تا الان منتشر نشده بود، بسازن. نتایج این تحقیق، که یه ساختار سه‌بعدی جدید از ژنوم رو در دسته‌بندیِ خزندگان، پرندگان و پستانداران نشون میده، به بهبود راهکارهای حفاظتِ موثرتر از لاک‌پشت‌ها و مطالعه‌ی تکامل ژنومی و نظم‌دهیِ کروموزومی در مهره‌داران کمک می‌کنه.

این پژوهش به سرپرستی آورا روئیز-هررا (از آ یو اِی بی) و نیکول والنزوِلا (از دپارتمان ایالت آیووا) انجام شده و با همکاری محققای مؤسسه زیست‌شناسی تکاملی (CSIC-UPF) و کالیج ارلهم همراه بوده. این تحقیق که در نشریه‌ی Genome Research منتشر شده، نقش مهم کروماتین (یعنی اون ساختار سه‌بعدی که مواد ژنتیکی داخل هسته‌ی سلول توش تا میخوره و بسته‌بندی میشه) رو در تنظیمِ عملکرد ژن و تأثیرش روی تکامل و گونه‌زایی نشون میده.

یه تصویر از محقق‌ها که مشغول بررسی و مطالعه‌ی ژنوم لاک‌پشت‌ها تو یه آزمایشگاه هستن.

محققان با ترکیب کردن تکنیک‌های توالی‌یابی و بیان ژن، مجموعه‌های جدیدی (بدون مدل مرجع قبلی) از ژنوم کامل دو گونه لاک‌پشت از نوع کریپتودیران تولید کردن؛ که به لاک‌پشت‌های ِ گردنِ کوتاه هم معروفن. این دو لاک‌پشت، نماینده‌ی دو خانواده‌ی نسلی هستن که توش کروموزوم‌های جنسی به صورت مستقل تکامل پیدا کردن: یه خانواده با کروموزوم‌های XX/XY که در انسان‌ها و بقیه پستانداران یافت میشه، و یه خانواده هم با کروموزوم‌های ZZ/ZW که در پرنده‌ها و پروانه‌ها دیده میشه.

علاوه بر این، پژوهشگرا یه شکل جدید از کروماتین سه‌بعدی رو تو هر دو خانواده‌ی نسلی پیدا کردن: فراتر از اتفاقای وصل شدن/جدا شدن تو ژنوم‌های خطی، اونها یه الگو از تا شدن کروموزومی رو بررسی کردن که تعاملات مرکز کروموزومی و تلومر رو امکان‌پذیر می‌کنه. این کشفیات، یه سری سرنخ جدید درباره‌ی ساختار کروماتین سه‌بعدی در آمینیوت‌ها رو ارائه میده (آمینیوت‌ها، دسته‌ای هستن که خزندگان، پرندگان و پستاندارن توش قرار دارن).

تحقیقات جدید در مورد ژنوم لاک‌پشت و تاثیرش روی علم زیست‌شناسی

نیکول والنزوِلا، محقق از دپارتمان بوم‌شناسی، تکامل و زیست‌شناسی ارگانیسم‌ها در دانشگاه ایالت آیووا، میگه: «ما این‌طوری حدس میزنیم که الگوی متفاوتی که تو لاک‌پشت‌ها دیدیم، از یه وضعیت اولیه‌ی آمینیوت نشأت گرفته که یه پیکربندی هسته‌ای خاص داشته و روابط گسترده‌ای بین کروموزوم‌ها وجود داشته. این روابط در طول بازآرایی خطیِ ژنوم در لاک‌پشت‌ها و سایر مهره‌داران حفظ شده.» اون همچنین تأکید می‌کنه: «این یافته‌ها دانش ما رو درباره‌ی تکامل کروموزوم‌های جنسی زیاد میکنه و یه پایه محکم برای پژوهش‌های آینده در زمینه‌ی تکامل ژنوم و سازماندهی کروموزوم‌ها در بین مهره‌داران فراهم میکنه.»

تصویری که ساختار پیچیده‌ی DNA و کروماتین رو داخل هسته‌ی سلول نشون میده.

یه مدل اساسی برای تحقیقات علمی

در این مقاله، محققا به این اشاره می‌کنن که مطالعه‌ی ژنوم لاک‌پشت‌ها اطلاعات خیلی مهمی رو فراهم می‌کنه که میتونه فهم ما از زیست‌شناسی و تکامل رو عوض کنه. لاک‌پشت‌ها به خاطر طول عمرشون و مقاومتشون در برابر بیماری‌ها، یه مدل منحصر به فرد برای مطالعات علمی (از زیست‌پزشکی گرفته تا حفاظت از گونه‌ها) به حساب میان. رمزگشایی از ژنوم این موجودات میتونه به شناسایی ژن‌هایی که مسئول این ویژگی‌ها هستن کمک کنه و به پیشرفت پزشکی انسان، مخصوصاً تو زمینه‌های پیری و مقاومت در برابر بیماری‌ها، کمک کنه.

لاک‌پشتی که زیستگاهش رو درک میکنه و نشون‌دهنده‌ی تاریخ تکاملش هست.

علاوه بر این، ژنوم لاک‌پشت‌ها یه دریچه‌ی بی‌نظیر رو به سمت تکامل باز می‌کنه: این گونه‌های خزنده بیش از 250 میلیون سال وجود داشتن و تو رویدادای انقراض جمعی زنده موندن و به محیط‌های مختلفی سازگار شدن. مطالعه‌ی DNA اونها به درک بهتر مکانیسم‌های سازگاری و بقای اونها کمک می‌کنه که برای حفاظت از خود لاک‌پشت‌ها و بقیه گونه‌ها خیلی حیاتیه.

اولین مجموعه‌های ژنوم لاک‌پشت‌ها بیشتر از ده سال پیش منتشر شد. از اون زمان، دوازده مجموعه ژنوم از خانواده لاک‌پشت‌ها گزارش شده که نه مورد از اونها توالی ژنی‌شون شناسایی شده. آروئرا روئیز-هررا اینطور نتیجه‌گیری میکنه: «مجموعه‌های جدیدی که تولید شدن، الان به این فهرست اضافه شدن و اهمیت منابع ژنومی با کیفیت بالا رو برای پیشرفت زیست‌شناسی تکاملی و توسعه‌ای نشون میده.»

مقاله های شبیه به این مقاله

بیشتر بخوانید

دیدگاهتان را بنویسید

نشانی ایمیل شما منتشر نخواهد شد. بخش‌های موردنیاز علامت‌گذاری شده‌اند *